อาการอาหารไม่ย่อยแบบทำงานผิดปกติเป็นอาการผิดปกติหลายอย่าง เช่น อาการปวดหรือไม่สบายในบริเวณลิ้นปี่ อิ่มเร็ว คลื่นไส้ อาเจียน เรอ แสบร้อนกลางอก และอาการดังกล่าวไม่ได้เกิดจากความเสียหายของอวัยวะในระบบทางเดินอาหาร ลักษณะเด่นของโรคนี้ในเด็กคือ อาการปวดมักเกิดขึ้นที่บริเวณสะดือ (ร้อยละ 55-88) ในเด็กร้อยละ 95 อาการปวดจะเกิดขึ้นภายในขอบเขตของรูปสามเหลี่ยม โดยฐานของรูปสามเหลี่ยมคือซี่โครงด้านขวา และปลายของรูปสามเหลี่ยมคือวงแหวนสะดือ