การมีอยู่ของเชื้อ H. pylori ในเยื่อบุกระเพาะอาหารเป็นเวลานานทำให้เกิดการแทรกซึมของนิวโทรฟิลและลิมโฟไซต์ ซึ่งกระตุ้นให้เกิดการอักเสบและไซโตไคน์ที่ควบคุมภูมิคุ้มกัน ซึ่งก่อให้เกิดการตอบสนองเฉพาะของเซลล์ T และเซลล์ B และกระตุ้นให้เกิดกระบวนการฝ่อ เมตาพลาเซียแบบเนื้อเยื่อคั่นระหว่างหน้า และการเกิดเนื้องอก